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| 序号 | 发表日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 突变信息 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-Dec-15 |
Interaction of matrix components and cells regulating cellular and molecular processes of glioma cells
2025-Dec-15, Brain research
IF:2.6
Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2025.150006
PMID:41135929
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research paper | 本文分析了胶质瘤细胞在胶原蛋白和透明质酸基底上的迁移、增殖及转录组变化,揭示了细胞外基质成分对胶质瘤细胞行为的调控机制 | 在转录组层面系统比较了胶原蛋白与透明质酸基底对胶质瘤细胞的差异调控作用,鉴定出包括PIP4K2A在内的多个上调差异表达基因及相关信号通路 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 阐明细胞外基质成分(胶原蛋白和透明质酸)对胶质瘤细胞增殖、迁移及基因表达的调控作用,为潜在治疗靶点的发现提供依据 | U87胶质瘤细胞系及原代胶质瘤细胞 | 癌症生物学 | 癌症 | 转录组测序、AlamarBlue细胞活力检测、细胞迁移实验 | NA | 转录组 | U87胶质瘤细胞系及原代胶质瘤细胞(具体样本数量未在摘要中说明) |
| 2 | 2025-Nov-11 |
PIP4K2A: A Novel CD8+ T Cell-Related Biomarker Associated with Lung Function Decline in COPD
2025-Nov-11, Biochemical genetics
IF:1.6
Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11274-1
PMID:41217726
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research paper | 本研究通过生物信息学分析与实验验证相结合,鉴定了与COPD肺功能下降相关的CD8+ T细胞标志基因,并以PIP4K2A为核心构建了诊断模型 | 首次将PIP4K2A确立为COPD中CD8+ T细胞相关生物标志物,并证明其表达水平与肺功能下降显著相关,为COPD发病机制提供了新的分子视角 | 摘要中未明确说明研究局限性,样本量相对有限,且主要依赖公共数据库数据,临床验证样本规模未详细披露 | 阐明CD8+ T细胞参与COPD发展的分子机制,鉴定相关标志基因并构建诊断模型,评估其与肺功能的相关性 | COPD患者与健康对照者的肺组织样本,包含bulk RNA-seq及单细胞RNA-seq数据集,以及临床样本 | 免疫学、癌症生物学、分子生物学 | 慢性阻塞性肺疾病(COPD) | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、LASSO回归分析、GO/KEGG富集分析、线性回归分析、qRT-PCR | NA | 转录组数据(bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq)、临床基因表达数据(qRT-PCR) | 来自GEO数据库的COPD患者与健康对照者肺组织样本(具体数量未在摘要中说明),以及用于qRT-PCR验证的临床样本(具体数量未披露) |
| 3 | 2025-Sep-24 |
Exploring Phage Peptide Scaffolds: Tyrosinase-Mediated Cyclization for Selective Generation of Bioactive Cyclic Peptides
2025-Sep-24, Journal of the American Chemical Society
IF:15.7
Q1
DOI:10.1021/jacs.5c12291
PMID:40859814
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research paper | 开发了一种酪氨酸酶介导的噬菌体展示平台,通过邻醌-半胱氨酸偶联实现一步环化,并利用该平台筛选出靶向PIP4K2A等治疗相关蛋白的大环肽抑制剂 | 首次将酪氨酸酶介导的环化策略引入噬菌体展示平台,利用酪氨酸酶对工程化酪氨酸残基的高度选择性和空间约束性,实现对噬菌体衣壳蛋白天然酪氨酸的绕过,从而在不影响噬菌体感染活性的前提下高效构建大环肽库 | NA | 开发一种基于酶催化的噬菌体展示环化肽筛选平台,用于发现靶向治疗相关蛋白的生物活性大环肽抑制剂 | 酪氨酸酶介导的大环肽库及其对PIP4K2A激酶和PTP1B磷酸酶的抑制活性 | drug discovery | cancer | 噬菌体展示、酪氨酸酶介导的化学酶法环化、大环肽库构建、IC50活性测定 | NA | 生化活性数据(IC50) | NA |
| 4 | 2025-Sep-10 |
Ferulic Acid from Beta vulgaris subsp. vulgaris Altissima Group Pulp Targets the CaMKKβ/SIRT-1/AMPK Pathway To Combat Hyperglycemia
2025-Sep-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:6.2
Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c07776
PMID:40884506
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research paper | 从甜菜渣中纯化的阿魏酸通过CaMKKβ/SIRT-1/AMPK通路调控葡萄糖代谢以对抗高血糖 | 首次阐明甜菜渣来源的阿魏酸通过激活CaMKKβ/SIRT-1/AMPK信号轴及调控PI3K/Akt通路(包括PIP4K2A基因表达)来改善高血糖的分子机制 | 研究仅在HepG2细胞系中进行,缺乏体内动物模型验证阿魏酸单体的抗糖尿病效果 | 探究甜菜渣来源阿魏酸改善2型糖尿病高血糖的分子机制 | 高糖诱导的HepG2肝癌细胞系 | cell signaling, metabolism | metabolic disease | 细胞培养、Western blot、基因表达分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质组 | HepG2细胞系(具体样本数未在摘要中说明) |
| 5 | 2025-Aug-05 |
Polygenic risk scores of fasting insulin and insulin-related traits in a Taiwanese Han population
2025-Aug-05, Cell & bioscience
IF:6.2
Q1
DOI:10.1186/s13578-025-01454-2
PMID:40765060
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research paper | 通过GWAS和多基因风险评分(PRS)分析,探索台湾汉族人群中与空腹胰岛素水平相关的遗传变异,并评估其与代谢疾病的关联 | 在台湾汉族人群中首次发现PIP4K2A和rs3846601为空腹胰岛素易感性的新型显著位点,并构建了基于空腹胰岛素相关位点的PRS模型,用于代谢疾病的早期风险评估 | GWAS未发现全基因组显著位点,PIP4K2A和rs3846601仅接近显著性阈值;研究人群局限于台湾汉族,结果的普适性有待验证 | 探索台湾汉族人群中与空腹胰岛素水平变化相关的遗传变异,并开发PRS模型以评估代谢疾病风险 | 台湾汉族人群的空腹胰岛素水平及相关遗传变异 | genetics | metabolic disease | GWAS、多基因风险评分(PRS)分析、PheWAS | PIP4K2A基因附近的SNP位点接近全基因组显著性阈值,被鉴定为空腹胰岛素易感性的新型候选位点;具体变异的HGVS命名未在摘要中提供 | 基因组数据(SNP基因分型)、临床表型数据(空腹胰岛素水平、BMI、疾病诊断) | 包含初级组、验证组和随访组的台湾汉族人群,具体样本量未在摘要中明确说明 |
| 6 | 2025-Jul |
Non-canonical functions of PIP4K2A and its role in cancer biology: A review
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:8.5
Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145157
PMID:40505929
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综述 | 探讨PIP4K2A的非经典功能及其在癌症生物学中的作用 | 揭示了PIP4K2A的激酶非依赖性功能,特别是在RNA加工中的新作用,以及其在不同癌症类型中的双重角色(原癌基因和抑癌基因) | NA | 综述PIP4K2A的非经典功能及其在癌症中的意义 | PIP4K2A蛋白及其在多种癌症中的功能 | cancer biology | cancer, lymphoma, glioblastoma | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2025-Jun-15 |
Integrating Multiomics to Reveal and Validate Key Proteins, Metabolites, and Pathways of ASB14 Affecting Mitochondrial Function in Cardiomyocytes AC16
2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
DOI:10.1096/fj.202500366R
PMID:40417864
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research paper | 通过多组学整合分析揭示ASB14通过调控下游蛋白和代谢物影响心肌细胞线粒体功能的机制 | 首次整合蛋白质组学和代谢组学揭示ASB14调控心肌细胞功能的下游蛋白、代谢物及关键通路,发现ASB14通过亚油酸代谢和嘌呤代谢通路抑制线粒体功能 | 研究仅在AC16心肌细胞系中进行体外实验,缺乏体内动物模型验证;未深入探讨ASB14与下游蛋白之间的直接相互作用机制 | 阐明ASB14影响心肌细胞功能的调控机制及其下游蛋白和代谢物 | AC16心肌细胞系、ASB14蛋白及其下游差异蛋白和代谢物 | cell signaling, metabolism | cardiovascular disease | CCK8细胞增殖检测、流式细胞术、ATP水平检测、TMT-iTRAQ蛋白质组学、LC-MS/MS代谢组学、Western blotting | NA | proteome, metabolome | AC16心肌细胞系,分为ASB14过表达组(pCDH-ASB14转染)和对照组(pCDH-NC转染) |
| 8 | 2025-Jan-02 |
Loss of PI5P4Kα Slows the Progression of a Pten Mutant Basal Cell Model of Prostate Cancer
2025-Jan-02, Molecular cancer research : MCR
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0290
PMID:39382632
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research paper | 研究PI5P4Kα(PIP4K2A)缺失对Pten突变型前列腺癌基底细胞模型进展的影响 | 首次建立了靶向基底细胞特异性敲除Pip4k2a的基因工程小鼠模型,发现PI5P4Kα在前列腺基底细胞中富集,其缺失可减缓Pten突变驱动的前列腺上皮内瘤变进展,并通过单细胞RNA测序揭示脂质代谢紊乱是肿瘤进展减缓的潜在机制 | 摘要中未明确说明研究局限性,但研究主要基于小鼠模型及细胞系实验,临床转化证据有限 | 探究PI5P4Kα在前列腺上皮基底细胞中的功能及其在Pten突变型前列腺癌进展中的作用 | 基底细胞特异性Pip4k2a敲除基因工程小鼠模型、Pten突变小鼠前列腺组织、LNCaP前列腺癌细胞 | 癌症生物学 | 癌症(前列腺癌) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因工程小鼠模型(GEMM)、谱系示踪、siRNA敲低、转录组通路分析、组织病理学分析 | NA(本文未报告PIP4K2A基因的具体变异或突变位点,研究采用基因敲除模型而非自然变异) | 转录组数据(单细胞RNA测序)、脂质组学数据(肉碱脂质谱)、组织病理学数据 | 基因工程小鼠模型(具体数量未在摘要中说明)及LNCaP前列腺癌细胞系 |
| 9 | 2025 |
Exploring Potential Drug Targets in Multiple Cardiovascular Diseases: A Study Based on Proteome-Wide Mendelian Randomization and Colocalization Analysis
2025, Cardiovascular therapeutics
IF:3.4
Q2
DOI:10.1155/cdr/5711316
PMID:40026415
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research paper | 通过蛋白质组范围的孟德尔随机化和共定位分析,识别多种心血管疾病的潜在药物靶点蛋白,并评估相关蛋白的潜在副作用 | 首次系统性地将蛋白质组范围孟德尔随机化与共定位分析结合,针对冠心病、慢性心力衰竭、缺血性卒中和2型糖尿病等多种心血管疾病同时筛选因果性血浆蛋白靶点,并通过PheWAS评估靶点的潜在副作用;PIP4K2A被鉴定为2型糖尿病的正向因果关联蛋白,并通过共定位分析确认其与心血管疾病共享单一因果变异 | NA | 识别与多种心血管疾病具有因果关联的血浆蛋白,为潜在治疗靶点的发现提供依据,并评估靶向这些蛋白的潜在药物副作用 | 血浆蛋白与心血管疾病(冠心病、慢性心力衰竭、缺血性卒中、2型糖尿病)之间的因果关系 | drug discovery | cardiovascular disease | 蛋白质组范围孟德尔随机化(proteome-wide Mendelian randomization)、共定位分析(colocalization analysis)、蛋白质数量性状位点分析(pQTL)、全基因组关联研究(GWAS)、表型组范围关联研究(PheWAS) | NA | 蛋白质组数据(血浆蛋白水平)、GWAS汇总统计数据、pQTL数据 | pQTL研究涉及35,559名个体的4,907种循环蛋白水平数据;GWAS数据来源于UK Biobank及芬兰数据库(FinnGen R10,包含2,408种表型,分为44组) |
| 10 | 2025 |
MicroRNA analysis of porcine muscle tissue involved in phosphoinositol metabolism
2025, Frontiers in veterinary science
IF:2.9
Q1
DOI:10.3389/fvets.2025.1482031
PMID:40777826
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research paper | 通过高通量测序比较兰德瑞斯猪与滇南小耳猪背最长肌中差异表达miRNA,并分析其靶基因在磷酸肌醇代谢通路中的功能 | 首次系统鉴定滇南小耳猪肌肉组织中的差异表达miRNA,并揭示其靶基因(包括PIP4K2A在内)与磷脂酰肌醇信号通路的关联 | 研究仅基于生物信息学预测靶基因功能,未对PIP4K2A等关键基因进行实验验证;样本仅限于两个猪品种的背最长肌组织 | 阐明miRNA在猪肌肉组织中的生物学功能,为滇南小耳猪优质种质资源的发掘与利用提供理论基础 | 兰德瑞斯猪与滇南小耳猪的背最长肌组织 | 分子生物学 | NA | Solexa高通量测序、小RNA文库构建、GO富集分析、KEGG通路富集分析 | NA | 转录组(small RNA测序数据) | 两个猪品种(兰德瑞斯猪与滇南小耳猪)各取背最长肌组织样本,具体样本数量未在摘要中说明 |