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| 序号 | 发表日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 突变信息 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2021-Nov-11 |
Discovery and Characterization of the Potent and Highly Selective 1,7-Naphthyridine-Based Inhibitors BAY-091 and BAY-297 of the Kinase PIP4K2A
2021-Nov-11, Journal of medicinal chemistry
IF:6.8
Q1
DOI:10.1021/acs.jmedchem.1c01245
PMID:34699202
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research paper | 报道了基于1,7-萘啶骨架的PIP4K2A激酶高效高选择性抑制剂BAY-091和BAY-297的发现与表征 | 通过高通量筛选和基于结构的优化，首次开发出高选择性PIP4K2A抑制剂BAY-091和BAY-297，并利用细胞热位移实验验证了其细胞内靶标结合活性，可作为研究PIP4K2A信号通路的化学探针 | BAY-091和BAY-297对PIP4K2A的抑制未能在p53缺陷肿瘤细胞中转化为预期的作用机制和抗增殖活性，提示PIP4K2A抑制与肿瘤生长抑制之间的关联尚未得到验证 | 开发针对PIP4K2A的高效高选择性小分子抑制剂，并探究其在p53突变/缺失肿瘤中的抗肿瘤潜力 | PIP4K2A激酶及其抑制剂BAY-091和BAY-297，以及p53缺陷肿瘤细胞 | drug discovery | cancer | 高通量筛选（HTS）、基于结构的药物优化、细胞热位移实验（CETSA） | NA | 生化活性数据、细胞生物学数据 | NA |
| 2 | 2021-Oct-19 |
Association of PIP4K2A Polymorphisms with Alcohol Use Disorder
2021-Oct-19, Genes
IF:2.8
Q2
DOI:10.3390/genes12101642
PMID:34681036
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research paper | 本研究探讨了PIP4K2A基因多态性与俄罗斯男性酒精使用障碍（AUD）之间的关联 | 首次证明PIP4K2A基因多态性（rs2230469和rs746203）与酒精使用障碍存在关联，推测其机制与通过调控外侧缰核影响多巴胺系统有关 | 研究对象仅限于俄罗斯男性，样本量相对有限，结果的普适性有待验证 | 探究PIP4K2A基因多态性与酒精使用障碍的遗传关联 | 279名患有酒精使用障碍的俄罗斯男性及222名健康俄罗斯男性对照 | genetics | 酒精使用障碍（精神/成瘾性疾病） | TaqMan SNP基因分型，实时荧光定量PCR（Applied Biosystems QuantStudio 5） | rs2230469（TT/T基因型/等位基因，与AUD风险升高相关，p=0.026/p=0.0084）；rs746203（T等位基因，在AUD患者中频率更高，p=0.023）；两者均为PIP4K2A基因多态性位点，具体核苷酸变异类型未在摘要中说明 | 基因组DNA，SNP基因分型数据 | 279名AUD患者（俄罗斯男性）及222名健康对照（俄罗斯男性），共501人 |
| 3 | 2021-Aug-03 |
PIP4Ks impact on PI3K, FOXP3, and UHRF1 signaling and modulate human regulatory T cell proliferation and immunosuppressive activity
2021-Aug-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.1
Q1
DOI:10.1073/pnas.2010053118
PMID:34312224
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research paper | 研究PIP4K激酶家族对人调节性T细胞增殖和免疫抑制活性的影响,发现抑制PIP4K可重编程Treg细胞特性而不影响常规T细胞功能 | 首次阐明PIP4K激酶在人类调节性T细胞信号转导中的作用机制,发现PIP4K抑制可选择性影响Treg而不影响常规T细胞,为肿瘤免疫治疗和自身免疫疾病治疗提供新的药物靶点策略 | 研究主要基于离体人原代T细胞实验,缺乏体内模型验证;PIP4K抑制剂的长期安全性和临床应用潜力需要进一步评估 | 探究PIP4K激酶家族在人类调节性T细胞信号转导、增殖和免疫抑制功能中的作用机制 | 人原代调节性T细胞(Tregs)和常规T细胞(Tconv) | 免疫学, 细胞信号转导, 磷酸肌醇代谢 | 肿瘤, 自身免疫疾病 | CRISPR基因编辑, 药理学抑制, 流式细胞术, 细胞增殖检测, 免疫抑制功能检测 | 文章提到PIP4K2C基因附近的人类单核苷酸多态性(SNP)与自身免疫疾病易感性相关,但未报告PIP4K2A基因的具体突变信息 | 转录组, 蛋白质组, 细胞功能数据 | 人原代T细胞样本(具体样本数量未在摘要中说明) |
| 4 | 2021-Jul |
Thermal proteome profiling identifies PIP4K2A and ZADH2 as off-targets of Polo-like kinase 1 inhibitor volasertib
2021-Jul, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
DOI:10.1096/fj.202100457RR
PMID:34143546
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research paper | 利用热蛋白质组分析（TPP）鉴定PLK1抑制剂volasertib的脱靶蛋白，发现PIP4K2A和ZADH2是其真实脱靶靶点 | 首次通过全蛋白质组热稳定性分析系统性鉴定volasertib的脱靶蛋白，证实PIP4K2A是volasertib而非其他PLK1抑制剂的特异性脱靶靶点，为解释其临床副作用提供了新的分子机制 | 文章未深入阐明PIP4K2A和ZADH2被volasertib抑制后导致副作用的具体机制，且约200个潜在脱靶蛋白中大多数未经实验验证 | 鉴定PLK1抑制剂volasertib的潜在脱靶蛋白，以解释其临床副作用的来源，并为开发更具特异性的药物提供依据 | PLK1抑制剂volasertib及其脱靶蛋白PIP4K2A和ZADH2，以及volasertib处理的细胞蛋白质组 | drug discovery | leukemia | 热蛋白质组分析（TPP）、质谱分析（mass spectrometry） | NA | 蛋白质组学数据 | NA |
| 5 | 2021-May-18 |
Signature RNAS and related regulatory roles in type 1 diabetes mellitus based on competing endogenous RNA regulatory network analysis
2021-May-18, BMC medical genomics
IF:2.0
Q3
DOI:10.1186/s12920-021-00931-0
PMID:34006268
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research paper | 通过竞争性内源RNA（ceRNA）调控网络分析，鉴定1型糖尿病（T1DM）中的特征RNA及其潜在调控作用 | 构建了T1DM相关ceRNA调控网络，发现PIP4K2A等基因参与磷脂酰肌醇信号系统，并与多巴胺能突触、胰岛素信号通路共同构成T1DM的关键重叠通路，同时鉴定出四个相关lncRNA（LINC01278、TRG-AS1、MIAT、GAS5-AS1） | 样本量较小（12例T1DM患者和10例正常对照），且研究基于公开数据库的生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探究T1DM中特征RNA的表达模式及其通过ceRNA网络参与疾病发生发展的潜在调控机制 | T1DM患者外周血单核细胞中的lncRNA、mRNA和miRNA表达谱 | 分子生物学 | 代谢性疾病 | 生物信息学分析、差异表达分析、ceRNA网络构建、功能与通路富集分析 | NA | 转录组（lncRNA、mRNA、miRNA表达谱） | 22例样本（12例T1DM患者和10例正常对照），来源于GEO数据库GSE55100数据集 |
| 6 | 2021-Feb |
Distribution and localization of phosphatidylinositol 5-phosphate, 4-kinase alpha and beta in the brain
2021-Feb, The Journal of comparative neurology
IF:2.1
Q1
DOI:10.1002/cne.24956
PMID:32449185
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research paper | 该研究通过基因敲除小鼠验证的特异性抗体,系统表征了PI5P4Kα和PI5P4Kβ两种激酶在脑内的分布和定位模式 | 首次使用经基因敲除验证的特异性抗体系统描绘了PI5P4Kα和PI5P4Kβ在脑内的细胞类型特异性表达模式,发现PI5P4Kα主要定位于少突胶质细胞和白质,而PI5P4Kβ主要表达于神经元,并在超微结构水平证实两者存在于突触结构中 | 研究主要集中在形态学定位分析,缺乏对这两种激酶在脑功能中具体作用机制的功能性实验验证 | 阐明2型磷脂酰肌醇-5-磷酸4-激酶α和β在脑内的分布、定位及其在突触功能中的潜在作用 | 小鼠、猕猴和人脑组织中的PI5P4Kα和PI5P4Kβ蛋白 | 神经科学 | NA | 免疫组织化学、免疫荧光双标记、超微结构分析、基因敲除小鼠模型 | NA | 组织学成像数据、免疫标记数据 | 小鼠脑组织(包括pip4k2a和pip4k2b基因敲除小鼠)、猕猴脑组织和人脑组织 |
| 7 | 2021 |
Analysis of the Neuroproteome Associated With Cell Therapy After Intranigral Grafting in a Mouse Model of Parkinson Disease
2021, Frontiers in neuroscience
IF:3.2
Q2
DOI:10.3389/fnins.2021.621121
PMID:33776636
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research paper | 在帕金森病小鼠模型中,通过黑质内移植胚胎腹侧中脑组织进行细胞治疗后,使用液相色谱-串联质谱技术分析了五个黑质纹状体相关脑区的神经蛋白质组变化 | 首次系统性地分析了帕金森病细胞治疗后多个脑区的蛋白质组动态变化,发现了7个在所有研究脑区共同下调的蛋白(包括Pip4k2a),揭示了细胞移植通过降低氧化应激和恢复神经递质机制促进黑质纹状体通路修复的分子机制 | 研究仅在动物模型中进行,观察时间点有限(移植后1天和7天),需要更长期的随访和人类临床验证 | 探索帕金森病细胞治疗后黑质纹状体通路重建的分子机制 | 6-羟基多巴胺诱导的帕金森病小鼠模型,接受E12.5胚胎腹侧中脑组织黑质内移植 | 神经科学 | 帕金森病 | 液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)、系统生物学分析、细胞移植 | NA | 蛋白质组 | 帕金森病小鼠模型的五个黑质纹状体相关脑区样本,包括非移植对照组和移植后1天、7天组 |
| 8 | 2021 |
"Modulating Phosphoinositide Profiles as a Roadmap for Treatment in Acute Myeloid Leukemia"
2021, Frontiers in oncology
IF:3.3
Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.678824
PMID:34109125
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综述 | 探讨通过调控多磷酸肌醇代谢途径,特别是核内途径,作为急性髓系白血病治疗的潜在策略 | 提出结合生物信息学分析与多磷酸肌醇途径抑制,特别是核内途径,发现针对急性髓系白血病的新型联合疗法,通过重编程转录输出来抑制白血病细胞生长 | NA | 探索靶向多磷酸肌醇代谢酶作为急性髓系白血病治疗靶点的可行性 | 多磷酸肌醇及其调控酶(包括PIP4K2A)在急性髓系白血病中的作用 | cancer biology, phosphoinositide metabolism | leukemia | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2021 |
Conserved RNA Binding Activity of Phosphatidyl Inositol 5-Phosphate 4-Kinase (PIP4K2A)
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:4.0
Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.631281
PMID:34124142
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research paper | 发现磷脂酰肌醇5-磷酸4-激酶(PIP4K2A)具有保守的RNA结合活性,该活性独立于其激酶活性,并可能在疟原虫传播和多细胞生物基因表达调控中发挥作用 | 首次发现PIP4K2A具有RNA结合活性,且该活性独立于其激酶功能;发现PIP4K2A从宿主被输入到疟原虫中;证明PIP4K2A的RNA结合活性在从酵母、疟原虫到人类的物种间保守 | 研究主要基于疟原虫模型,PIP4K2A在人类细胞中调控的具体靶标RNA尚未明确;RNA结合的分子机制和结构基础未详细阐述 | 研究磷脂酰肌醇5-磷酸4-激酶(PIP4K2A)的RNA结合活性及其在疟原虫生命周期和基因表达调控中的作用 | 疟原虫(Plasmodium)、PIP4K2A蛋白、特定mRNA的3'UTR保守元件 | 分子生物学, 细胞信号转导, 磷酸肌醇代谢 | 感染(疟疾) | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2021 |
Analyses of Long Noncoding RNA and mRNA Profiles in Subjects with the Phlegm-Dampness Constitution
2021, BioMed research international
IF:2.3
DOI:10.1155/2021/4896282
PMID:34926685
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research paper | 通过微阵列分析痰湿质人群外周血单个核细胞中长链非编码RNA和mRNA的表达谱,探索其在代谢性疾病中的调控作用 | 首次揭示了痰湿质人群中lncRNA/mRNA的表达特征,发现了多个具有潜在调控关系的lncRNA-mRNA配对(如RP11-809C18.3-PIP4K2A),提示痰湿质的独特体质和临床特征可能部分归因于lncRNA/mRNA的特异性表达模式 | 样本量相对较小(痰湿质13例,平和质9例),仅分析了外周血单个核细胞,未在其他组织或更大队列中验证;lncRNA-mRNA调控关系主要基于生物信息学预测,缺乏功能验证实验 | 探究痰湿质人群中长链非编码RNA和mRNA的独特表达特征及其调控网络,阐明其与代谢性疾病易感性的关系 | 痰湿质人群(n=13)和平和质人群(n=9)的外周血单个核细胞 | 分子生物学 | 代谢性疾病 | microarray, RT-qPCR, 生物信息学分析(共表达网络构建、顺式调控靶基因分析、IPA通路分析) | NA | 转录组 | 22例受试者(痰湿质13例,平和质对照9例) |