PIP4K2A 基因相关文献库

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序号 发表日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 突变信息 数据类型 样本量
1 2018-Jan-15
Regional evaluation of childhood acute lymphoblastic leukemia genetic susceptibility loci among Japanese
2018-Jan-15, Scientific reports IF:3.9 Q1
research paper 在日本儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)患者中评估已知GWAS易感位点的遗传关联性,并分析日本人群与其他族群间的连锁不平衡差异 首次在日本人群中系统评估儿童ALL的遗传易感性位点,发现ARID5B和PIP4K2A的风险关联可直接迁移至日本人群,而IKZF1的关联则通过另一个替代SNP(rs1451367)被检测到 样本量相对有限(527例B细胞ALL),且仅针对已知GWAS区域进行靶向分析,未进行全基因组范围的新位点发现 评估在欧洲和西班牙裔人群中发现的儿童ALL遗传易感性位点是否在日本人群中同样适用,并探讨不同族群间连锁不平衡模式的差异 日本儿童急性淋巴细胞白血病患者(0-19岁)及健康对照人群 cancer biology leukemia SNP微阵列基因分型、SNP填充(imputation)、连锁不平衡分析(varLD评分)、GWAS关联分析 rs7088318(PIP4K2A位点,OR = 0.76,P = 2×10⁻⁴),为已报道的儿童ALL易感SNP,在日本人群中关联性得到验证;未报告具体的编码变异或HGVS命名的突变 基因组(SNP基因分型数据) 527例B细胞ALL患者,3,882例对照样本(来自Nagahama研究组和爱知癌症中心研究)
2 2018
Regulatory Network and Prognostic Effect Investigation of PIP4K2A in Leukemia and Solid Cancers
2018, Frontiers in genetics IF:2.8 Q2
research paper 系统研究PIP4K2A在白血病及多种实体肿瘤中的转录调控网络与预后效应 首次通过全基因组基因表达关联分析在儿童B-ALL队列中系统鉴定PIP4K2A的表达相关基因与通路,揭示其在多种癌症中的分子亚型分类潜力及独立于分期的预后价值 研究主要依赖生物信息学分析与公开数据库(如TCGA),缺乏功能性实验验证;调控网络的因果关系尚未得到实验证实 探究PIP4K2A在白血病及实体肿瘤中的转录调控网络、分子亚型分类能力及预后效应 儿童B-ALL患者队列及TCGA多癌种队列中的肿瘤样本 癌症生物学 白血病、癌症 全基因组基因表达关联分析、生物信息学分析、转录组数据挖掘、分子亚型聚类分析、生存分析 文中提及PIP4K2A的胚系变异(germline variants)可通过诱导其过表达影响急性淋巴细胞白血病(ALL)的易感性,但未提供具体的HGVS命名变异位点信息 转录组数据(基因表达谱)、公共癌症数据库数据(TCGA) 儿童B-ALL队列(具体样本量未明确说明)及TCGA多癌种队列(具体样本量未明确说明);共鉴定出214个与PIP4K2A表达显著相关的候选基因
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