PIP4K2A 基因相关文献库

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[IF不过滤] [发表日期:201011-201011] [清除筛选条件]
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序号 发表日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 突变信息 数据类型 样本量
1 2010-Nov-19
In silico ascription of gene expression differences to tumor and stromal cells in a model to study impact on breast cancer outcome
2010-Nov-19, PloS one IF:2.6 Q2
research paper 利用组织病理学估算的肿瘤与间质成分比例,对198例乳腺肿瘤样本进行计算机模拟基因表达归因分析,将差异表达基因分别归属于肿瘤上皮细胞或间质细胞,并与远处转移结局相关联 提出一种无需物理显微切割、利用病理信息与加权t统计量将差异表达基因计算性归因于肿瘤上皮细胞或间质细胞的方法,并发现PIP4K2A(PIP5K2A)在远处转移组的间质细胞中显著上调 方法依赖组织病理学对细胞成分比例的估算,存在一定主观性;分析基于bulk肿瘤microarray数据,细胞类型归因为计算推断而非直接测量 开发一种计算方法,将乳腺肿瘤bulk组织基因表达差异归因于肿瘤上皮细胞或间质细胞,并识别与远处转移相关的细胞类型特异性基因 198例新鲜冷冻乳腺肿瘤组织样本及独立的激光捕获显微切割浸润性导管癌基因表达数据集 癌症生物学 癌症 微阵列基因表达分析(microarray)、激光捕获显微切割(laser capture microdissection)、加权t统计量、计算机模拟细胞类型归因 NA 转录组 198例新鲜冷冻乳腺肿瘤组织样本(用于主要分析),另有独立的激光捕获显微切割浸润性导管癌样本集(用于验证,具体数量未提及)
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